В случае, если суд назначает проведение экспертизы, ее оплачивает государство. Если же инициатором выступает истец или ответчик, он вносит оплату на указанный судом счет. Важно отметить тот факт, что эксперт либо организация, ответственная за проведение строительной экспертизы не имеет права отказать о ее проведения, если оплата не поступила на счет заблаговременно. По завершению экспертизы, если денежные средства не поступили на счет, экспертная организация может подать вместе с экспертным заключением заявление об оплате расходов. Так как в действующем ГПК нет статьи, регулирующие данные взаимоотношения сторон, взыскивать средства экспертный центр будет без поддержки суда. Немаловажным будет и тот факт, что экспертное учреждение обязано будет погасить налоги в отчетном периоде, когда проводилась строительная экспертиза, не учитывая были ли получены денежные средства или нет.